蚂蝗的天敌主要包括水蜈蚣、蛇、鱼类、青蛙、蚂蚁、水鸟、龙虾、黄鳝等动物。其中，水蜈蚣和蛇虽然不常以蚂蝗为主食，但在食物匮乏时也会捕食蚂蝗。
而老鼠和蚂蚁对蚂蝗的威胁则更为直接，老鼠会大量吞食蚂蝗，蚂蚁则会对产卵期的蚂蝗及其卵造成威胁。此外，鸟类如翠鸟也会捕食蚂蝗。这些动物都在不同程度上对蚂蝗的种群数量起到控制作用。
