清除鱼塘中过多的河蚌，可以使用生石灰来杀死河蚌。或者使用漂白粉，漂白粉的有效成分为次氯酸和氢氧化钙，具有强力杀菌作用。
也可以在里面养一些底栖肉食性水产动物，吃掉河蚌幼仔，控制河蚌繁殖。比如小龙虾、青鱼、甲鱼。同时，河蚌也可以捞出来做菜销售，或者剔出蚌肉养殖甲鱼、小龙虾、鸭子等。
